天天天天天天天天日操|久久免费观看一级毛片|七月丁香色婷婷综合激情|国产精品一区二区三乱码|亚洲乱码中文字幕手机在线|嫩草伊人久久精品少妇AV|成人午夜精品无码区久久中文|亚洲日韩精品一区二区三区高清

IGO世界糧油展會(huì)logo IGO世界糧油展(IGO China)

第18屆IGO世界糧油展會(huì)

The 18th International Grain and Oil Exhibition 2025

2025年6月12-14日

廣州?廣交會(huì)展館
& 首頁 » 媒體中心 » 行業(yè)資訊

科學(xué)家構(gòu)建 高質(zhì)量水稻泛基因組

時(shí)間: 2022-05-17
來源:科技日?qǐng)?bào),原題:《科學(xué)家構(gòu)建 高質(zhì)量水稻泛基因組》

科技日?qǐng)?bào)訊 (記者馬愛平)近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所水稻分子設(shè)計(jì)技術(shù)與應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)和上海交通大學(xué)合作,基于111份代表性水稻資源的二代和三代全基因組測(cè)序數(shù)據(jù),構(gòu)建了高質(zhì)量水稻泛基因組,獲得了9個(gè)水稻代表性群體的高質(zhì)量參考基因組,其中包括5個(gè)無缺水稻基因組。相關(guān)數(shù)據(jù)對(duì)深度挖掘基因組變異和優(yōu)良基因,培育突破性的水稻新品種提供了重要依據(jù)。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《基因組研究》上。

據(jù)中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所研究員王文生介紹,該團(tuán)隊(duì)于2018年就在《自然》上發(fā)表了相關(guān)論文,對(duì)來自全球89個(gè)國家的3010份水稻進(jìn)行了重測(cè)序和大數(shù)據(jù)分析,這3010份水稻代表了全球78萬份核心種質(zhì),從而構(gòu)建了首個(gè)完整的亞洲栽培稻泛基因組。但是此前的研究是基于二代測(cè)序技術(shù)進(jìn)行數(shù)據(jù)構(gòu)建的,相比而言,使用三代測(cè)序技術(shù)構(gòu)建的數(shù)據(jù)質(zhì)量會(huì)更高。

此次研究構(gòu)建的泛基因組在原來的基礎(chǔ)上,增加了三代測(cè)序數(shù)據(jù),因此構(gòu)建的泛基因組更準(zhǔn)確、更連續(xù)、更完整,包含879Mb的非冗余新序列,涉及19319個(gè)新的蛋白質(zhì)編碼基因(2132個(gè)新基因家族)。與二代測(cè)序數(shù)據(jù)相比,三代測(cè)序數(shù)據(jù)在檢測(cè)基因存在—缺失變異(PAV)時(shí)假陽性率更低,尤其是對(duì)于包含重復(fù)序列的基因。此外,研究還檢測(cè)到14471個(gè)存在-缺失變異與多個(gè)農(nóng)藝性狀有顯著關(guān)聯(lián),表明基因存在—缺失變異對(duì)水稻表型變異可能具有重要貢獻(xiàn)。該研究獲得的高質(zhì)量水稻基因組、泛基因組和基因存在—缺失變異等資源,有利于促進(jìn)水稻功能基因組研究,同時(shí)有助于深度挖掘基因組變異和優(yōu)良基因,對(duì)培育突破性的水稻新品種提供了重要依據(jù)。

該研究得到國家自然科學(xué)基金、海南崖州灣種子實(shí)驗(yàn)室“揭榜掛帥”項(xiàng)目、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程和國家高層次人才支持計(jì)劃等項(xiàng)目支持。